| 转录生成的RNA是初级产物，需要加工修饰。原核生物和真核生物初级转录产物都需经一定程度的加工才具有活性。真核生物转录和翻译的部位被核膜隔开，转录后修饰复杂。
真核生物mRNA由不均一核RNA加工而成，包括首尾修饰及剪接加工。mRNA的功能是转录核内编码蛋白质信息的DNA碱基排列顺序，并携带至细胞质，指导蛋白质合成。mRNA分子从5＇-末端开始，每三个核苷酸为一组决定肽链上的一个氨基酸，称为三联体密码。之后的连续三联体密码组成的核苷酸序列称为开放阅读框（ORF），是多肽链的编码顺序。
内含子是非编码序列，通过剪接而除去，但它不是基因中没有功能的废料。有编码功能的mRNA则是经剪接后由外显子串成。第Ⅲ类内含子的剪接需要核内小RNA和不均一核RNA结合剪接体，剪接的化学反应是二次转酯反应。
外显子和内含子分别代表基因的编码和非编码序列。因转运RNA和核蛋白体RNA成熟过程也需剪接，外显子在断裂基因及其初级转录产物上出现，并表达为成熟RNA的核酸序列。内含子是隔断基因的线性表达而剪接过程中被除去的核酸序列。
mRNA的剪接就是去除初级转录产物上的内含子，把外显子连接为成熟的RNA。根据罗杰用电镜拍摄的检晶仪图片：内含子区段弯曲，使相邻的两个外显子互相靠近而利于剪接，称为套索RNA。这就是罗杰最初提出的剪接模式。
剪接体是由核内小RNP与不均一核RNA结合，使内含子形成套索并拉近上、下游外显子距离的复合体。剪接体是mRNA剪接的场所。
mRNA编辑是编码序列的加工，由同一基因可以产生不同的蛋白质。这种加工过程是遗传信息在转录水平发生改变，由一个基因产生不止一种蛋白质。RNA编辑作用说明，基因的编码序列经过转录后加工，是可有多用途分化的，因此，也称为分化加工。
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